สำหรับระบบ FAT ทั้ง 2 แบบ มีข้อแตกต่างกันดังนี้
1. FAT 16 จะใช้กับระบบปฏิบัติการ DOS, Windows 3.x จนถึง Windows 95 OEM ส่วน FAT 32 เริ่มมีใน Windows 95 OSR 2.0
2. FAT 16 ใช้กับฮาร์ดดิสก์ที่มีความจุไม่เกิน 2 กิกะไบต์ในหนึ่งพาร์ติชัน ส่วน FAT 32 จะสนับสนุนฮาร์ดดิสก์ในปัจจุบันที่มีความจุสูง รองรับได้มากถึง 2 เทรา ไบต์ (1 Tera Byte เท่ากับ 1,024Gb) ในหนึ่งพาร์ติชัน
3. FAT 16 จะสิ้นเปลืองพื้นที่ในการเก็บข้อมูลมากกว่า เพราะขนาดคลัสเตอร์ ซึ่งเป็นที่ที่ใช้เก็บ ข้อมูลในฮาร์ดดิสก์ใหญ่กว่า FAT 32 ดังตารางต่อไปนี้
เปรียบเทียบขนาดของฮาร์ดดิสก์หรือพาร์ติชันและขนาดของคลัสเตอร์ FAT 16 และ FAT 32
FAT 16 FAT 32
ขนาด HDD ขนาดคลัสเตอร์ ขนาด HDD ขนาดคลัสเตอร์
2 GB 32 KB >32 GB-2TB 32 KB
1 GB 16 KB >16 GB-32GB 16 KB
512 MB 8 KB >8 GB-16GB 8 KB
256 MB 4 KB 260 MB-8GB 4 KB
128 MB 2 KB น้อยกว่า 260 MB 2 KB
หมายเหตุ
ขนาดฮาร์ดดิสก์หรือพาร์ติชันกับขนาดคลัสเตอร์ FAT 16 สัมพันธ์กันดังนี้
1. ฮาร์ดดิสก์ความจุไม่เกิน 128 MB จะมีขนาดคลัสเตอร์ 2 KB
2. ฮาร์ดดิสก์ความจุมากกว่า 128 MB - 256 MB จะมีขนาดคลัสเตอร์ 4 KB
3. ฮาร์ดดิสก์ความจุมากกว่า 256 MB - 512 MB จะมีขนาดคลัสเตอร์ 8 KB
4. ฮาร์ดดิสก์ความจุมากกว่า 512 MB - 1 GB จะมีขนาดคลัสเตอร์ 16 KB
5. ฮาร์ดดิสก์ความจุมากกว่า 1 GB - 2 GB จะมีขนาดคลัสเตอร์ 32 KB
ขนาดฮาร์ดดิสก์หรือพาร์ติชันกับขนาดคลัสเตอร์ FAT 32 สัมพันธ์กันดังนี้
1. ฮาร์ดดิสก์ความจุน้อยกว่า 260 MB จะมีขนาดคลัสเตอร์ 2 KB
2. ฮาร์ดดิสก์ความจุตั้งแต่ 260 MB - 8 GB จะมีขนาดคลัสเตอร์ 4 KB
3. ฮาร์ดดิสก์ความจุมากกว่า 8 GB - 16 GB จะมีขนาดคลัสเตอร์ 8 KB
4. ฮาร์ดดิสก์ความจุมากกว่า 16 GB - 32 GB จะมีขนาดคลัสเตอร์ 16 KB
5. ฮาร์ดดิสก์ที่มีความจุมากกว่า 32 GB - 2 TB จะมีขนาดคลัสเตอร์ 32 KB
หากเปรียบเทียบความสิ้นเปลือง ตัวอย่าง เช่น คุณมีฮาร์ดดิสก์ที่มีความจุ 2 GB และใช้ FAT16 ซึ่งจะมีขนาดคลัสเตอร์เท่ากับ 32 KB หรือประมาณ 32,000 ไบต์ ถ้าใช้เก็บไฟล์ที่มีขนาด 2 KB จำนวน 5 ไฟล์ ฮาร์ดดิสก์จะจองพื้นที่ 5 คลัสเตอร์เพื่อเก็บไฟล์ทั้ง 5 ไฟล์ โดยแต่ละไฟล์ที่มีขนาด เพียง 2 KB เมื่อนำไปเก็บใน คลัสเตอร์ที่มีขนาด 32 KB จะเหลือที่ว่าง 30 KB เมื่อเก็บทั้งหมด 5 ไฟล์ ก็จะสิ้นเปลืองพื้นที่ไป 5 คูณ 30 = 150 KB และพื้น ที่ว่างๆ เหล่านี้คอมพิวเตอร์จะไม่ สามารถนำมา ใช้เก็บข้อมูลได้อีก แต่ถ้าใช้ FAT32 ขนาดฮาร์ดดิสก์ที่มีความจุ 2 GB จะมีขนาดคลัสเตอร์เพียง 4 KB เมื่อเก็บไฟล์ขนาด 2 KB 5 ไฟล์ จะเหลือที่ว่างๆ เพียงแค่ 10 KB เท่านั้นเอง คุณอาจสังเกตเห็น ความเปลี่ยนแปลง นี้ที่ค่อนข้างชัดเจน ถ้าคุณได้ก็อปปี้ไฟล์ในแผ่นซีดีรอมไปไว้ในฮาร์ดดิสก์ที่มีขนาด 2 GB แบบ FAT16 คุณจะเห็นว่า เมื่อก็อปปี้เสร็จแล้วขนาดฮาร์ดดิสก์ถูกใช้ไปมากกว่าขนาดของไฟล์ใน แผ่นซีดีรอม ทั้งนี้ก็เพราะ ว่าขนาดของคลัสเตอร์ไม่เท่ากันนั่นเอง การ ทดสอบที่มองเห็นผลชัดเจนที่สุด ให้ก็อปปี้ไฟล์ที่มีขนาดเล็กจำนวนมากๆ เช่น ไฟล์เพลง Karaoke ในแผ่นซีดี KXTV หรือดาวน์โหลด ไฟล์จากอินเตอร์เน็ต ไปไว้ใน ฮาร์ดดิสก์แบบ FAT16 และ FAT32 ที่มีความจุเท่ากัน ก็จะเห็นความแตก ต่างชัดเจนเลยว่า ภายหลังการก็อปปีฮาร์ดดิสก์แบบ FAT16 จะใช้พื้นที่เก็บไฟล์มากกว่า เหลือพื้นที่ ว่างในฮาร์ดดิสก์น้อยกว่า
