ไฟล์เอกสารที่สร้างด้วยโปรแกรมนี้ จะเป็นไฟล์แบบ *.P65 สำหรับเวอร์ชัน 6.5 และ *.pmd สำหรับเวอร์ชัน 7 แต่ทั้งนี้ก็ขึ้นอยู่กับเวอร์ชั่นของโปรแกรม PageMaker เช่น ในเวอร์ชั่น 5 นามสกุล จะเป็น Pm5 เวอร์ชั่น 6 Pm6 การจะเลือกใช้โปรแกรม PageMaker รุ่นใดให้ดูที่ร้านเพลทที่จะไปใช้ บริการด้วย ถ้าร้าน เพลทใช้รุ่น 6.5 ก็ควรติดตั้งให้ตรงกัน แต่ถ้าไม่ได้ทำเพลทก็ไม่จำเป็น
สำหรับไฟล์ที่สร้างในโปรแกรมนี้ จะมีอยู่ไม่มากนัก ขึ้นอยู่กับเนื้อหาของหนังสือ เช่น ไฟล์ปก ปกใน คำนำ สารบัญ บทที่1... บทที่2... บทที่3... ภาคผนวก รวมๆ กัน แล้วก็ไม่กี่สิบไฟล์ ถึงจะปะ ปนกับไฟล์อื่นก็ไม่น่าจะมีปัญหาอะไร แต่การสร้างที่เก็บแยกไว้โดยเฉพาะจะเป็นการดีกว่า ซึ่งผู้เขียน แนะนำให้เก็บไฟล์เหล่านี้รวมไว้ใน โฟล์เดอร์ที่เก็บไฟล์แบบ Tiff หรือไฟล์รูปภาพที่สร้างด้วย Photoshop นั่นเอง ไฟล์สองประเภทนี้ควรเก็บไว้ที่เดียวกัน เพื่อความสะดวกในการเรียกใช้งานของคุณเอง